定制化液相芯片

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定制化液相芯片

芯片性能测试报告

测试数据分析结果包含了目标区域指标汇总、性能雷达图、不同区域覆盖情况等内容，全面而详细地展示了芯片的各项性能。

目标区域指标汇总（表一）
Sample	24R00300CS	24R00301CS	说明
Raw bases(Mb)	**	**	原始数据总碱基数
Clean bases(Mb)	**	**	Clean data总碱基数
QCrate(%)	**	**	过滤比率Clean bases(Mb)/Raw bases(Mb)
Target average read length	**	**	目标区域平均序列长度
Target average base quality	**	**	目标区域平均碱基质量
Target average insert size	**	**	目标区域平均插入片段长度
Target duplicated bases(Mb)	**	**	目标区域重复碱基数
Target duplication rate(%)	**	**	目标区域重复碱基率
Total mapped reads(M)	**	**	总共比对到参考基因组上的序列数
Total reads mapping rate(%)	**	**	序列比对率
Target mapped reads(M)	**	**	比对到目标区域上的序列数
Target reads capture rate(%)	**	**	序列捕获效率，Target mapped reads(M)/Total mapped reads(M)
Flank mapped reads(M)	**	**	比对到目标区域及侧翼 150bp上的序列数
Flank reads capture rate(%)	**	**	目标区域及侧翼 150bp的捕获效率
Target size	**	**	目标区域大小
Target covered size	**	**	目标区域实际覆盖到的大小
Coverage rate(%)	**	**	覆盖率
Target effective bases(Mb)	**	**	目标区域上的有效碱基数，去除了重复序列碱基
Target effective rate(%)	**	**	有效碱基率
Target mean depth	**	**	目标区域平均深度 (以总目标区域为分母)
T4X coverage rate(%)	**	**	深度>=4X的目标区域比率，也叫4X覆盖度
T 10X coverage rate(%)	**	**	深度>=10X的目标区域比率，也叫10X覆盖度
T 20X coverage rate(%)	**	**	深度>=20X的目标区域比率，也叫20X覆盖度
T 30X coverage rate(%)	**	**	深度>=30X的目标区域比率，也叫30X覆盖度
T 10%X coverage rate(%)	**	**	深度>=平均深度10%X 的目标区域比率
T 20%X coverage rate(%)	**	**	深度>=平均深度20%X 的目标区域比率
T 30%X coverage rate(%)	**	**	深度>=平均深度30%X 的目标区域比率
T50%X coverage rate(%)	**	**	深度>=平均深度50%X 的目标区域比率