互作转录组测序-产品介绍-威尼·至尊国际(中国)

威尼·至尊国际(中国)

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宏转录组测序

宏转录组—捕捉微生态微环境活性微生物动态变化

宏转录组测序：
（Metatranscriptome Sequencing/ Metatranscriptomics）从整体水平研究特定环境中所有群体基因组转录情况和调控规律，以微生态微环境中全部RNA为研究对象，结合高通量测序从转录水平研究复杂微生物群落变化，挖掘发挥功能的活性基因。
全面高效：
高通量全面捕捉微生态环境中所有生物转录本，剖析微生物多样性组成及动态变化，鉴定优势物种与活性微生物，筛选活性功能基因。
分析多样：
针对不同研究需要研发两套分析流程。一套针对微生物多样性与功能基因表达情况的分析；一套针对于微环境中病毒鉴定与功能的研究。

应用方向

医药领域
病毒鉴定、人体微生物与疾病/癌症关系的研究、分子标志物和药物靶点的鉴定与筛选等
生态领域
研究胁迫环境下微生物的机体响应机制
工业领域
微生物活性物质开发、生物能源、环境污染监控与生物修复等

诺禾优势

1. 样本起始量低
RNA 1μg/建库
2. 周期快、分析全，稳定性高
诺禾宏转录组采用先进的Illumina平台测序，并与高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）结合，实现快速、稳定的测序数据分析及交付。
- ≤30
  样本量
- 60天
  项目周期
- PE150
  测序读长
- ≥85%
  测序质量Q30
3.质控严格，分析流程多样
诺禾宏转录组建库要求去除核糖体的方式提高有效数据占比，并采用主流软件Trinity进行后续分析，针对不同需求配置高级分析... 从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都经过科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。

材料选取

RNA样品
≥ 1 μg

文库构建
普通文库

PE150测序
5~10Gb

信息分析
4. 项目文章以及物种经验丰富
威尼·至尊国际(中国)已经成功完成对土壤/水体富集的菌体、淤泥、沉积物等多种微环境样本，肠道内容物、拭子、粪便、体液、发酵物、食品等多种类型样本的宏转录组测序分析。涉及物种包括人、大小鼠、绵羊、牛、鸡、鱼、蜱虫、蜜蜂、珊瑚虫、蜘蛛、西洋参、油茶、矮紫衫、地衣、海绵等近百个物种，助力客户在Microbiome等权威杂志发表多篇高水平文章。“科学的方案设计，严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务”，确保每一个环节都能出色完成，助力科学研究。
- 80人
  分析团队
- 7年
  项目经验
- 1000+
  结题项目
- 1对1
  项目服务

信息分析

威尼·至尊国际(中国)宏转录组测序项目，不仅进行基因表达情况分析，还进行物种注释及分类分析，多样品间的比较分析等。此外，威尼·至尊国际(中国)给予个性化分析的服务，可以根据客户需求定制分析内容。

WGBS	分析内容	解决问题
标准分析	数据过滤与质控	过滤掉低质量数据，保证数据质量
	Tinity拼接	测序数据拼接成长的转录本
	Nr数据库比对	注释活性物种、挖掘优势物种或差异物种、分类鉴定
	功能注释（GO、KEGG、eggNOG、CAZy）	物种与功能注释
	基因表达水平分析	进行定量与差异分析
	GO富集、KEGG富集	核心基因GO，KEGG功能富集分析

关联分析

顺利获得宏转录组与宏基因组、16s进行比较，可以帮助我们分析DNA与RNA层面的共有与差异物种，挖掘活性微生物；与代谢组进行关联分析，挖掘活性物种或核心基因与代谢物之间的关系，寻找相关代谢通路。现在，由于微生物的多样性与复杂性，依据课题建议选取关注的物种或基因群进行后续相关的分析，威尼·至尊国际(中国)可以给予相应的个性化分析服务。

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样本类型	送样量
total RNA	浓度：≥ 50ng/μL 体积：20μL ≤ V ≤ 120μL 总量：≥ 1μg
菌体/菌丝	≥ 1*10⁷ 个 ≥ 0.5
新鲜植物组织干重	≥ 0.8
新鲜动物组织干重	≥ 0.5
粪便	≥ 1g，建议3g
肠道内容物	0.5-1g
活性污泥/淤泥/沉积物类	10-15mL（约4-5g沉降物）
土壤	≥ 2g（建议富集菌体沉淀)

常见问题

1.宏转录组一般推荐多少数量?
- 粪便或肠道内容物，推荐5G数据量；
  环境类样本比如土壤、水体，推荐10G数据量；
  组织类等宿主占比较高的样本，推荐至少10G数据量。
  建议根据研究目的来选择数据量。

2.宏转录组生信分析内容中包括物种注释及差异基因分析吗？
- 包括。在我们的标准分析流程中，包括物种注释及差异基因的分析内容，以及物种与基因两个维度的功能注释。同时，根据不同的分析需求，威尼·至尊国际(中国)还推出针对于病毒的宏病毒组分析内容，包括已知病毒的鉴定和分析。另外，针对不同研究方向，威尼·至尊国际(中国)也给予个性化分析的服务。
  威尼·至尊国际(中国)拥有专业的设计方案、严格的质控管理，专业的分析团队，丰富的项目经验，优质的项目服务，确保每一个环节都能出色完成，助力您的科学研究。

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