16S 、18S、ITS 目标区域扩增子二代测序-经典案例-威尼·至尊国际(中国)
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    基因组测序

    16S、18S、ITS等扩增子测序(二代)

    肺炎支原体肺炎患儿呼吸道微生物群失衡

    Respiratory microbiota imbalance in children with Mycoplasma pneumoniae pneumonia

    期刊:Emerging Microbes&Infections
    影响因子:19.568
    发表单位:北京儿童医院
    发表年份:2023年5月

    一、研究背景

    虽然以前的研究报道了传染病中呼吸道微生物群失调,但关于肺炎支原体肺炎(MPP)儿童下呼吸道(LRTs)微生物群失衡的数据不足。研究表明在MPP组中检测到的柔膜菌和支原体的丰度显著增加,分别超过总细菌群的67%和65%。与轻度MPP组相比,重度MPP组α多样性降低,支原体丰度显著升高。与轻度MPP患儿相比,重度MPP患儿支原体丰度与并发症及临床指标呈正相关。本文的研究描述了MPP患儿LRT菌群的特征,并揭示了其与疾病严重程度的关系。这一发现为儿童MPP的发病机制给予新的见解。

    二、方法流程

    取材
    建库
    测序
    分析

    158例MPP患儿和29例细菌性或病毒性肺炎患儿(对照组)的支气管肺泡灌洗液

    构建PCR-free文库

    肺泡灌洗液进行16S rRNA V3-V4基因测序

    1.OTU聚类和分析
    2.α-多样性
    3.β-多样性
    4. LEfSe分析

    三、研究结果

    • 1、MPP患儿呼吸道微生物群分析

      MPP组的Shannon指数和Simpson指数均低于对照组,两组间β多样性差异显著。在对照组中,厚壁菌门和变形菌门是最占优势的门,分别占总序列的47.95%和32.5%,而在MPP组中,柔膜菌门的丰度显著增加,超过总微生物群的67%。对细菌分类群进行LEfSe分析,结果显示支原体在MPP组中显著富集,占总支原体含量的6.65%。链球菌和嗜血杆菌是下一个最丰富的属,分别占MPP组肺部微生物群的6%和3%。在对照组中,链球菌和嗜血杆菌的丰度分别增加到41%和18%,代表肺部微生物群中的优势菌株。
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    • 2、下呼吸道微生物群与MPP严重程度的关系

      158例MPP患者中,重度57例(36.1%),轻度101例(63.9%)。结果显示,重度MPP组呼吸微生物群α多样性显著低于轻度MPP组。重度组和轻度组的β多样性差异无统计学意义。在重度MPP患儿中,柔膜菌和支原体的丰度显著增加。此外,与轻度疾病的儿童相比,在重度MPP儿童中也检测到更高比例的嗜血杆菌。
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    • 3、基于不同诊断标准与MPP相关的呼吸微生物群

      根据MPP RNA阳性(n = 99)、MPP特异性抗体阳性结果(n = 51)和临床证据(n = 8)诊断为MPP的儿童的呼吸道微生物群进行分析。三组之间的α或β多样性未发现显著差异。同样,我们分析了三组之间微生物群的组成,没有发现组成差异。在这三组中,在门和属水平上纤毛虫和支原体的丰度最高。
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    四、研究结论

    该文章描述了MPP患儿LRT菌群的特征,并揭示其与疾病严重程度的关联。结果表明,在LRT中丰富的MPP有可能有助于MPP的诊断。


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